线粒体基因组是不同无脊椎动物分类群的系统发育和进化研究的重要标记序列，但它们在环节动物中的应用十分有限。在本文中，我们报道了燐虫科（环节动物）四个属的七个物种线粒体基因组，利用cox1、18S、28S和编码基因进行系统发育分析。结果展示，燐虫属和中燐虫属是高支持的单系姊妹分支，而叶燐虫属和稚燐虫属是并系的，这两个属是燐虫属 + 中燐虫属混合分支姐妹。虽然线粒体基因顺序在燐虫科中较为保守，但它们似乎与环节动物的祖先基因顺序相差较大。此外，燐虫科的13个蛋白质编码基因都在经历强纯化选择，而叶燐虫属物种相较于其他属大多数物种表现出更高的碱基取代率，这表明纯化选择具有更加宽松的范围。总体而言，我们的研究为燐虫的系统发育研究提供了分子数据，突出了对这个科进行全面修订的必要性，特别是在理解叶燐虫属和稚燐虫属的并系关系中发挥着重要作用。
 

碱基替换，系统发生，基因顺序重排，遗传距离，多毛纲