碳酸盐岩在冷泉区分布广泛，是除水体和沉积物外微生物重要的栖息生境，对甲烷滤除也具有重要作用。冷泉碳酸盐岩生境中微生物的分布特征及适应机制尚不明确，该栖息地融合了沉积物的厌氧特性和底层水的有氧特性，具有多样化和复杂的微生物群落。我们发现碳酸盐岩生境中的微生物主要以甲烷氧化菌、硫酸盐还原菌、硫氧化菌、发酵菌、氨氧化古菌为主。但碳酸盐岩生境表现出显著的空间异质性，而不同的生境特征会对微生物造成不同的环境选择压力，从而导致甲烷氧化微生物的生态位分化。在喷口附近的潜铠虾繁茂区域，ANME-2c占据主导地位，喷口外围的贻贝繁茂区，ANME-1b优势性明显，而未有大型生物聚集的裸露的碳酸盐岩区和还原性沉积物区，甲基球菌占据主导地位。相较于水体、沉积物和岩石表面，岩石内部的微生物倾向于有更强的互作潜力，以适应岩石内部的局促环境。同时，剧烈的快速的环境梯度变化，导致生境的快速转变，以甲烷氧化菌为中心的微生物之间的协作也发生了变化以适应这一资源更有限的环境。

冷泉,碳酸盐岩,甲烷氧化,微生物,互作